這次我們要來介紹幾種常用來生產生質燃油的藻種。以供應生質燃油原料為目標的養殖場在選擇藻種時通常會有幾個考量。第一個考量為生長速度，生長速度會直接影響到生物質產量，一般而言，藻類大約每6至72小時生物質會增加一倍，生長速度越快則能採收的頻率越高。第二個考量為藻體含油量，目前藻類生質燃油仍以生質柴油為主，藻體含油量高就表示會有較多藻油能被轉換為生質柴油。然而藻體含油量高的藻種通常生長速度會比藻體含油量低的藻種慢，因此生長速度與含油量之間的取捨需考慮到最終燃油產物為何，以選擇較適當的藻種。第三個考量為藻類生長環境，依照預想的培養環境選擇藻種。例如在陸地上的養殖場便不適合培養海水藻，因為此舉必須承擔配製人工海水的額外費用。其他還有一些諸如藻體形狀、生活形態、自營異營（註一）等特性在篩選藻種時也應一併考慮。
螺旋藻 (Spirulina)
螺旋藻就跟它的名字一樣，單一個體就是螺旋狀長條，大小約為 0.5 毫米(mm)。可在淡水及鹹水中生長，可進行自營及異營作用。螺旋藻是非常常見的培養藻種，因為它的生長速度快，大小相對於其他微藻大得多因此容易收集，適應環境能力強，夏威夷、中國大陸南部、美國加州等熱帶地區皆有養殖廠 。螺旋藻大部份成份為蛋白質，僅有約10-20%成份為油脂，因此不適合作為生質柴油原料藻種。然而也因為高蛋白質含量而適合作為營養品或是動物飼料。若讀者平時有留心注意的話，在一般藥局常常可見的螺旋藻錠，即是由這些螺旋藻製成。
